Depuis 1976, plus d’une trentaine d’épidémies de maladie à virus Ebola (MVE) ont été détectées en Afrique sub-Saharienne, dont 8 depuis 2013, dernière année sans épidémie de MVE. Les deux plus grandes épidémies ont frappé l’Afrique de l’Ouest, et en particulier la Guinée, le Liberia et la Sierra Leone, de 2014 à 2016, et l’Est de la République Démocratique du Congo de 2018 à 2020, faisant respectivement 11343 et 2299 victimes.
Etant donné l’issue très souvent fatale de l’infection par le virus Ebola, il est généralement admis que celui-ci n’infecte pas l’être humain de manière endémique. Les flambées épidémiques correspondraient ainsi plutôt à des évènements d’émergence zoonotique. Les chauves-souris sont les candidates les plus sérieuses au statut de réservoir mais la question est encore loin d’être définitivement tranchée. Chaque nouvelle épidémie constitue une occasion importante de mieux comprendre l’écologie et le processus d’émergence du virus Ebola.
En mars 2021, une deuxième épidémie d’Ebola était déclarée en Afrique de l’Ouest, en Guinée. Cette épidémie allait affecter au moins 16 personnes (cas confirmés), et en tuer 12. Les autorités sanitaires locales, épaulées par plusieurs équipes internationales, ont pu reconstruire la chaîne des infections jusqu’à un cas index plausible, une infirmière probablement décédée de la maladie à la fin du mois de janvier.
Comme c’est désormais devenu la norme, le séquençage sur site, et en quasi temps réel, de génomes viraux fut réalisé. Les premières séquences partielles confirmèrent que des 4 espèces de virus pouvant causer la MVE, celle impliquée était aussi celle contre laquelle des vaccins et traitements efficaces étaient disponibles, permettant leur mise en œuvre rapide.
L’analyse des génomes complets allait révéler une information bien plus surprenante. Ceux-ci semblaient en effet dériver directement de la précédente épidémie Ouest-africaine, pourtant terminée en 2016. On le voit clairement dans un arbre phylogénétique représentant les relations de parenté des virus Ebola de cette espèce: les séquences de l’épidémie de 2021 sont toutes nichées au sein de la diversité virale générée entre 2014 et 2016 (Figure 1).
Autre conclusion étonnante: la branche de l’arbre menant aux virus de 2021 est bien plus courte qu’attendue. En appliquant des modèles d’horloge moléculaire (dont le ‘tic-tac’ représente l’accumulation plus ou moins régulière des mutations au cours du temps), un ralentissement du taux d’évolution d’un facteur 6 peut être détecté. À vrai dire, lorsqu’on demande à ces mêmes modèles d’estimer l’âge des séquences de 2021, ils suggèrent la date de 2015, les replaçant au cœur de l’épidémie précédente.
Ces résultats indiquent clairement que l’épidémie de 2021 ne fait pas suite à une nouvelle émergence zoonotique mais représente plutôt une résurgence de celle de 2014-6. Un des mécanismes envisageables est une latence ou dormance du virus dans des sites anatomiques immunoprivilégiés; on sait par exemple que le virus peut persister des mois dans le sperme de patients guéris. On sait désormais également que des résurgences similaires ont eu lieu lors d’autres épidémies, par exemple lors de celle du Nord-Kivu en 2018-20. L’épidémie de 2021 en Guinée démontre cependant que de tels évènements peuvent se produire bien plus longtemps après la fin d’une précédente épidémie que ce que nous pensions jusqu’alors.
Environ 20000 personnes ont survécu aux épidémies de MVE au cours des 10 dernières années. La découverte des résurgences de MVE montre que le suivi de ces patients est absolument crucial pour prévenir de futures épidémies. Ce suivi devra comprendre des mesures d’accompagnement adaptées, pour éviter que ces populations déjà très fragilisées ne soient encore davantage stigmatisées.
Sebastien Calvignac-Spencer, Ph.D.
Epidemiology of Highly Pathogenic Microorganisms Viral Evolution Robert Koch Institut
CalvignacS@rki.de
www.leendertz-lab.org www.pathogen-museomics.org
Lire l‘article source :
Keita AK, Koundouno FR, Faye M, Düx A, Hinzmann J, Diallo H, Ayouba A, Le Marcis F, Soropogui B, Ifono K, Diagne MM, Sow MS, Bore JA, Calvignac-Spencer S, Vidal N, Camara J, Keita MB, Renevey A, Diallo A, Soumah AK, Millimono SL, Mari-Saez A, Diop M, Doré A, Soumah FY, Kourouma K, Vielle NJ, Loucoubar C, Camara I, Kourouma K, Annibaldis G, Bah A, Thielebein A, Pahlmann M, Pullan ST, Carroll MW, Quick J, Formenty P, Legand A, Pietro K, Wiley MR, Tordo N, Peyrefitte C, McCrone JT, Rambaut A, Sidibé Y, Barry MD, Kourouma M, Saouromou CD, Condé M, Baldé M, Povogui M, Keita S, Diakite M, Bah MS, Sidibe A, Diakite D, Sako FB, Traore FA, Ki-Zerbo GA, Lemey P, Günther S, Kafetzopoulou LE, Sall AA, Delaporte E, Duraffour S, Faye O, Leendertz FH, Peeters M, Toure A, Magassouba NF. Resurgence of Ebola virus in 2021 in Guinea suggests a new paradigm for outbreaks. Nature. 2021 Sep;597(7877):539-543. doi: 10.1038/s41586-021-03901-9. Epub 2021 Sep 15. PMID: 34526718.
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34526718/
TrevorFal
I gave https://www.cornbreadhemp.com/collections/cbd-cream a prove with a view the primary time, and I’m amazed! They tasted distinguished and provided a be under the impression that of calmness and relaxation. My lay stress melted away, and I slept well-advised too. These gummies are a game-changer for me, and I highly put forward them to anyone seeking spontaneous worry liberation and improved sleep.
ThomasSet
I’m in attraction with the cbd products and cbd pm ! The serum gave my shell a youthful rise, and the lip balm kept my lips hydrated all day. Meaningful I’m using clean, natural products makes me desire great. These are now my must-haves in support of a unorthodox and nourished look!
Gwcpea
order atorvastatin 20mg buy lipitor pills for sale order lipitor 10mg generic
Hltlix
buy propecia 1mg sale buy proscar pill order fluconazole
Ghokiv
purchase ciprofloxacin – augmentin 1000mg without prescription buy generic augmentin over the counter
Ultlnk
buy ciprofloxacin pills – keflex 125mg pills buy augmentin 625mg online
Bsxrou
ciplox 500 mg uk – ciprofloxacin uk erythromycin 250mg tablet
Qvlpxh
buy metronidazole 400mg pills – order cefaclor capsules buy azithromycin tablets
Nqpqug
ivermectin 6 mg tablets – buy generic cefuroxime order tetracycline 500mg pills
Zkwewd
valacyclovir 500mg us – valtrex buy online zovirax 400mg tablet
Cvtzia
acillin for sale buy amoxil paypal amoxil sale
Wjsuek
flagyl 200mg canada – purchase amoxicillin sale zithromax 250mg drug
Eagpoj
furosemide 100mg oral – buy furosemide sale diuretic captopril oral
Xxcwbm
metformin 500mg for sale – buy duricef generic order lincocin generic
Poanni
pill zidovudine 300 mg – cheap allopurinol 300mg
Vuhqkh
clozaril online – buy glimepiride 1mg pill cost pepcid
Gpdaff
buy generic seroquel online – how to get desyrel without a prescription buy eskalith pills for sale
Tlupmp
buy clomipramine cheap – purchase celexa online cheap doxepin uk
Etmcma
buy atarax 25mg online – lexapro 20mg ca oral amitriptyline
Burnuy
buy amoxiclav pills – buy acillin without prescription ciprofloxacin usa
Dtcbis
cheap amoxil pill – generic duricef order baycip pill
Ilclvg
azithromycin 250mg drug – buy zithromax tablets buy ciprofloxacin 500 mg
Pnsezt
buy clindamycin tablets – buy vantin 100mg pills chloramphenicol pill
Xcgiaj
where can i buy ivermectin – ivermectin 6mg oral oral cefaclor 250mg
Xrubeu
ventolin canada – buy seroflo generic order theophylline online
Awktoq
methylprednisolone 16mg tablet – buy generic fml-forte for sale buy generic azelastine 10 ml
Wlianp
desloratadine order online – flixotide where to buy purchase albuterol pills
Ywolyo
cheap micronase 2.5mg – where to buy pioglitazone without a prescription order forxiga 10 mg pills
Cnurjm
metformin online buy – buy acarbose 50mg buy acarbose 25mg
Cpzukn
order repaglinide 1mg without prescription – jardiance medication order jardiance sale