Chères et chers collègues,
La SFM vous propose de participer à une courte enquête portant sur les besoins et les ressources en bio-informatique des laboratoires de microbiologie médicale. L’objectif de ce questionnaire est d’établir un état des lieux, de favoriser la collaboration inter-laboratoire et d’explorer des pistes d’amélioration concrètes.
Le questionnaire comprend 9 questions et peut être complété en seulement 5 minutes
Le questionnaire comprend 9 questions et peut être complété en seulement 5 minutes
A la suite de vos réponses, nous ferons un retour des résultats obtenus qui sera diffusé auprès de la communauté. Nous vous remercions par avance vivement de votre participation.
Vos réponses
Merci beaucoup pour votre réponse au questionnaire de la SFM sur la Bio-Informatique en Microbiologie, voici une première analyse descriptive des réponses reçues :
Caractéristiques générales des répondants
| Caractéristique | Total, N = 144 | Bacteriologie, N = 58 | Mixte, N = 54 | Parasito-Mycologie, N = 6 | Virologie, N = 26 | p-valeur1 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Analyses_Bio_Info, n (%) | <0.001 | |||||
| Non | 52 (36) | 16 (28) | 30 (56) | 3 (50) | 3 (12) | |
| Oui | 92 (64) | 42 (72) | 24 (44) | 3 (50) | 23 (88) | |
| Realisation_sur_place, n (%) | 0.65 | |||||
| Non | 15 (16) | 8 (20) | 5 (21) | 0 (0) | 2 (8.7) | |
| Oui | 76 (84) | 33 (80) | 19 (79) | 3 (100) | 21 (91) | |
| Manquant | 53 | 17 | 30 | 3 | 3 | |
| Bio.info_dans_equipe, n (%) | 0.27 | |||||
| Non | 98 (68) | 34 (59) | 40 (74) | 5 (83) | 19 (73) | |
| Oui | 46 (32) | 24 (41) | 14 (26) | 1 (17) | 7 (27) | |
| Bio_info_temps_plein, n (%) | 0.56 | |||||
| Non | 14 (31) | 8 (33) | 3 (23) | 1 (100) | 2 (29) | |
| Oui | 31 (69) | 16 (67) | 10 (77) | 0 (0) | 5 (71) | |
| Manquant | 99 | 34 | 41 | 5 | 19 | |
| Interet_Webinars, n (%) | 0.082 | |||||
| Non | 22 (15) | 8 (14) | 13 (24) | 0 (0) | 1 (3.8) | |
| Oui | 122 (85) | 50 (86) | 41 (76) | 6 (100) | 25 (96) | |
| Ressource_IT, n (%) | 0.74 | |||||
| Non | 95 (66) | 39 (67) | 37 (69) | 3 (50) | 16 (62) | |
| Oui | 49 (34) | 19 (33) | 17 (31) | 3 (50) | 10 (38) | |
| Cluster_Analyse, n (%) | 0.64 | |||||
| Non | 95 (66) | 36 (62) | 39 (72) | 4 (67) | 16 (62) | |
| Oui | 49 (34) | 22 (38) | 15 (28) | 2 (33) | 10 (38) | |
| Stockage_Institut, n (%) | 0.007 | |||||
| Non | 60 (42) | 22 (38) | 31 (57) | 2 (33) | 5 (19) | |
| Oui | 84 (58) | 36 (62) | 23 (43) | 4 (67) | 21 (81) | |
| Outil_Partage_Code, n (%) | 0.35 | |||||
| Non | 127 (88) | 51 (88) | 49 (91) | 4 (67) | 23 (88) | |
| Oui | 17 (12) | 7 (12) | 5 (9.3) | 2 (33) | 3 (12) | |
| Interet_GitHub_microbiologie, n (%) | 0.014 | |||||
| Non | 35 (24) | 13 (22) | 20 (37) | 0 (0) | 2 (7.7) | |
| Oui | 109 (76) | 45 (78) | 34 (63) | 6 (100) | 24 (92) | |
| Structure, n (%) | <0.001 | |||||
| autre | 33 (23) | 15 (26) | 15 (28) | 1 (17) | 2 (7.7) | |
| CH | 29 (20) | 3 (5.2) | 26 (48) | 0 (0) | 0 (0) | |
| CHU | 82 (57) | 40 (69) | 13 (24) | 5 (83) | 24 (92) | |
| 1 test exact de Fisher | ||||||
Distribution par Discipline et Structure
Localisation des participants
QUESTION 1 : Utilisez vous des analyses bio-informatiques dans votre laboratoire?
| Caractéristique | N = 144 |
|---|---|
| Analyses_Bio_Info, n (%) | |
| Non | 52 (36) |
| Oui | 92 (64) |
Dans quel contexte?
Pour quelles applications?
QUESTION 2 : Avez-vous un(e) ou plusieurs bio-informaticien(ne)(s) dans votre équipe?
Nombre d’ETP Bio-Info par équipe
mediane [range] =1[0.2-5]
Niveau de diplôme des Bio-Informaticiens
Financement des Bio-Informaticiens
QUESTION 3 : Avez-vous des ressources IT (administrateur système/réseau/sécurité) en support à la bio-informatique ?
| Caractéristique | N = 144 |
|---|---|
| Ressource_IT, n (%) | |
| Non | 95 (66) |
| Oui | 49 (34) |
QUESTION 4 : Votre laboratoire a-t-il accès à un cluster d’analyse?
| Caractéristique | N = 144 |
|---|---|
| Cluster_Analyse, n (%) | |
| Non | 95 (66) |
| Oui | 49 (34) |
QUESTION 5 : Votre laboratoire a-t-il accès à un stockage institutionnel?
| Caractéristique | N = 144 |
|---|---|
| Stockage_Institut, n (%) | |
| Non | 60 (42) |
| Oui | 84 (58) |
QUESTION 6 : Utilisez-vous un outil de partage de code tel que GitHub pour partager vos codes et données ?
| Caractéristique | N = 144 |
|---|---|
| Outil_Partage_Code, n (%) | |
| Non | 127 (88) |
| Oui | 17 (12) |
QUESTION 7 : Seriez-vous intéressé(e) par la mise en place d’un GitHub/autre outil de partage pour la Microbiologie hospitalière française ?
| Caractéristique | N = 144 |
|---|---|
| Interet_GitHub_microbiologie, n (%) | |
| Non | 35 (24) |
| Oui | 109 (76) |
Quelles seraient vos attentes pour ce partage ? (plusieurs
réponses possibles)
QUESTION 8 : Seriez-vous interessé(e) par des webinaires mixtes cours/TP d’analyses bio-informatiques en Microbiologie?
| Caractéristique | N = 144 |
|---|---|
| Interet_Webinars, n (%) | |
| Non | 22 (15) |
| Oui | 122 (85) |
Par quel(s) thème(s) seriez-vous potentiellement intéressé(e)?
(plusieurs réponses possibles)
