Contexte de travail et missions
La personne recrutée travaillera à l’UMR FARE (Fractionnement des AgroRessources et Environnement) URCA/INRAE (https://www6.nancy.inra.fr/fare/).
L’UMR FARE développe une partie de ses activités de recherches dans le domaine de la transformation biologique des biomasses végétales et des lignines en mettant en œuvre de microorganismes et des enzymes.
Le/la post-doctorant(e) travaillera sur la mise en place de communauté bactérienne pour la valorisation des lignines. Il ou elle 1) mettra en place les approches permettant le suivi des différentes populations microbiennes par analyses cytometriques et par qPCR ; 2) étudiera la dynamique de production d’enzymes des populations les plus intéressantes par analyses protéomiques et métabolomiques ; 3) mettra en œuvre les enzymes produites en présence de lignines et analysera la transformation des substrats et la libération de molécules d’intérêts.
Activités
• Construction de communauté bactérienne synthétique
• Analyse de population par cytométrie
• Criblage des populations d’intérêts (microfermentation et quantification d’activité enzymatique moyen et haut débit, analyse substrat par spectroscopie, composition chimique ,…)
• Analyse protéomiques et métabolomiques
• Veille bibliographique dans le domaine d’activité
• Analyse des résultats et communications avec les différents partenaires
Compétences principales
Microbiologie (culturale et moléculaire) et écologie microbienne, fermentations,
Etudes et suivis de populations microbiennes (cytométrie en flux, FISH, qPCR…),
Omiques (protéomiques et métabolomiques) analyses des données méta-omiques (analyses statistiques; utilisation de bases de données…)
Rigueur, Curiosité scientifique, Autonomie
Communication, Esprit d’équipe
Capacités rédactionnelle et de synthèse
Compétences annexes
Enzymologie et mise en œuvre d’enzymes,
Techniques analytiques (HPLC, spectroscopie fluorescence, FTIR, RMN,…)
Omiques mise en œuvre (protéomiques et métabolomiques GC-MS, UHPLC-EST-HRMS)
Intérêt pour la valorisation biotechnologique des biomasses végétales et ses constituants dans le cadre de bioéconomie
Contraintes et risques
Pas de risque particulier
Déplacements chez les différents partenaires
Adresse du laboratoire d’accueil : UMR FARE, 2 esplanade Roland Garros, 51100 Reims
Type de contrat : Chercheur en contrat CDD
Durée du contrat : 12 mois
Date d’embauche prévue : 1 novembre 2025
Niveau de diplôme : Doctorat
Expérience souhaitée : 1 à 4 années
Pour candidater
Les candidat(e)s intéressé(e)s sont invité(e)s à envoyer un CV, une lettre de motivation, ainsi que les coordonnées de deux références académiques à harivony.rakotoarivonina@univ-reims.fr
Les candidat(e)s préselectionné(e)s seront convié(e)s à une entrevue courant septembre 2025
Date limite de candidature : 1er sept 2025 Prolongation jusqu’au 31 octobre 2025
