Du génotype au phénotype : patho-évolution des souches françaises de Mycobacterium bovis.
Doctorat de biologie à l’Agence nationale de sécurité sanitaire de l’alimentation, de l’environnement et du travail (ANSES)
Lieu de travail : Maisons-Alfort – Ile-de-France – France
Directeur de thèse : Maria Laura Boschiroli (maria-laura.boschiroli@anses.fr)
Co-directeur de thèse : Franck Biet (franck.biet@inra.fr)
Description du sujet
La tuberculose bovine (bTB), loin d’être une maladie du passé, est une zoonose dont l’impact économique reste aujourd’hui particulièrement élevé pour l’agriculture française. Ces dernières années, les cas de plus en plus fréquents de bTB identifiés, tant chez les animaux d’élevage comme dans la faune sauvage, ont complexifié la problématique et la gestion sanitaire de cette maladie à déclaration obligatoire. De nouvelles questions surgissent sur l’épidémiologie de cette maladie et la capacité de certaines souches à proliférer dans des systèmes multi-hôtes impliquant les bovins, la faune sauvage et leur environnement. Récemment nous avons obtenu des premières données génomiques de plusieurs dizaines de souches françaises et mis en évidence la présence de plusieurs complexes clonaux majeurs sur le territoire ainsi que l’émergence de génotypes dominants.
Le but de ce projet est d’établir le profil phénotypique de ces génotypes émergents de Mycobacterium bovis à large spectre d’hôtes par des nouvelles approches génomiques et biochimiques. Ce projet comprend trois tâches : 1/ obtention de séquences de référence par l’assemblage de novo (séquençage Illumina/PacBio) de génomes de souches appartenant aux groupes clonaux majoritaires ; 2/ recherche des évènements génomiques (insertion/délétion ou large sequence polymorphism (LSP)) sur l’ensemble des génomes ; étude de la variation génétique focalisée sur l’analyse des gènes de virulence, des gènes impliqués dans biosynthèse de l’enveloppe et des antigènes excrétés ; 3/ analyse des profils protéiques et lipidomiques par SDS PAGE, Western Blot, chromatographie en couche mince et analyses de spectrométrie de masse.
Fkicyo
order lipitor generic atorvastatin brand buy cheap atorvastatin
Kyzdru
buy generic baycip – buy generic augmentin 625mg augmentin 625mg drug
Rybkwo
generic cipro – cost cipro 1000mg augmentin 625mg us
Upmjsh
ciprofloxacin 500mg oral – buy generic chloramphenicol for sale erythromycin 250mg without prescription
Guurvh
cost flagyl – how to buy cefaclor order zithromax 250mg online
Ofizdz
ivermectin 12 mg – aczone over the counter buy generic tetracycline 250mg
Ktequk
valacyclovir pills – diltiazem price acyclovir 400mg ca
Djrabj
ampicillin antibiotic online acillin oral cheap amoxicillin
Xkviji
metronidazole tablet – brand flagyl 200mg order zithromax 500mg online cheap
Undavy
buy furosemide 40mg pill – buy warfarin without prescription purchase capoten pill
Sknnsr
glucophage 500mg cheap – oral baycip lincomycin over the counter
Sirizi
buy generic clozaril 100mg – order perindopril without prescription order famotidine 20mg without prescription