SARS-CoV-2 Mise à jour le 28/05/20

Fiches et Documents SFM

Réactifs/Evaluations

Liste des réactifs de diagnostic par RT-PCR du SARS-CoV-2 marqués CE Point au 05/05/2020 sur https://solidarites-sante.gouv.fr/IMG/pdf/liste-reactifs-diagnostic-rt-pcr.pdf

Liste des réactifs COVID-19 marqués CE disponible dans le monde : format pdf à télécharger (en date du 03/04/2020) ici ou sur https://www.finddx.org/covid-19/pipeline/?avance=all&type=all&status=CE-IVD&section=immunoassays#diag_tab

Mise au point du CNR sur la réalisation des prélèvements et la sensibilité des tests RT-PCR pour la détection du SARS-CoV-2 (09/05/2020)

Etats des lieux des évaluations des kits/réactifs par les CNR Virus respiratoires Lyon /IP (version du 18/05/2020)

Tests Sérologiques

  • Cahier des charges définissant les modalités d’évaluation des performances des tests sérologiques détectant les anticorps dirigés contre le SARS-CoV-2. Ces préconisations s’appuient sur les travaux publiés mentionnées ci-dessus ainsi que sur les auditions du Centre National de Référence des « Virus des infections respiratoires (dont la grippe) » le 01 avril 2020 (site de Paris) et le 09 avril 2020 (site de Lyon) en tant que parties prenantes (validation par le collège de la HAS en date du 16 avril 2020).
    → A télécharger ici
  • Place des tests sérologiques rapides (TDR, TROD, autotests) dans la stratégie de prise en charge de la maladie COVID-19 (MAJ 18/05/2020)
    → A télécharger ici
    « Après avoir défini les critères de performance exigibles pour les tests sérologiques COVID-19 et la stratégie d’utilisation des tests automatisables de type ELISA, la HAS publie ce jour la stratégie d’utilisation des tests unitaires qui élargissent les lieux et circonstances de test et donnent des résultats en quelques minutes. Les TDR et TROD trouvent leur place dans la surveillance épidémiologique et la stratégie diagnostique, tandis que le recours aux autotests apparaît prématuré. »
    https://www.has-sante.fr/jcms/p_3185170/fr/la-has-se-prononce-sur-les-tests-serologiques-rapides-tdr-trod-autotests-dans-la-lutte-contre-le-covid-19


Alerte masques

Autres liens ou textes utiles


Ressources scientifiques

Dashboard JHU
Dashboard WHO

John hopkins
WHO 

Mapping des Cas/décès pays par pays

Courbes d’incidence pays par pays
Limites : pas de données sur le nombre de tests réalisés
Santé Publique France

SantéPublique France

Agence Nationale de Santé Publique

–  Veille documentaire assez complète tout en bas à droite de la page (défaut : il faut retélécharger tous les pdf à chaque fois à bien ouvrir celui du jour)
– Lien vers l’observatoire cartographiqueGEODES à suivi indicateurs (hospi, réa, décès,par région, classe d’age, …), intéressant +++
National Institute of Health

NIH

US department of health & human service

Toute la recherche sur le COVID:
–  National Library of Medicine (COVID et Pubmed, clinical trials, explication du COVID-19 Open Research Dataset (CORD-19))
NIH Fogarty International Center : liens vers toutes les ressources biblio (Elsevier, Lancet, BMJ, Wiley, Mappings, NEJM)
+ sélection articles en continu à COMPLET +++
I3M/INSERM

Revue Inserm

Revue de littérature par I3M Institute

– Revue de littérature de qualité des papiers acceptés pertinents selon l’équipe I3M
COVID-NMA

https://covid-nma.com/

Cochrane France
Université de Paris
Inserm
APHP

Living mapping of research
Living network meta-analysis
Analyse recherche thérapeutique et méta-analyse en temps-réel
A suivre +++
LitCovid

NCBI/COVID

Site du NCBI sur littérature scientifique COVID Accès à toutes les dernières publications par pays/date/domaine (mécanism, treatment,  epidemic forectasting)
Pratique et complet +++
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