Mars 2021
Le complexe d’espèces Rasamsonia argillacea
REGNE : Eumycota (Fungi)
PHYLUM: Dikarya, Ascomycota
SOUS-DIVISION : Pezizomycotina
CLASSE : Eurotiomycètes
ORDRE : Eurotiales
FAMILLE : Trichocomaceae
GENRE : Rasamsonia
Le genre Rasamsonia a été créé en 2011 suite à la révision du genre Geosmithia. En effet, l’analyse phylogénétique (basée sur les séquences nucléotidiques des espaceurs transcrits internes (Internal Transcribed Spacers, ITS) 1 et 2 de l’ADN ribosomique et d’une partie des gènes codant la bêta-tubuline et la calmoduline) a conduit à reclasser certaines espèces du genre Geosmithia dans un nouveau genre Rasamsonia qui comporte actuellement 12 espèces distinctes, dont quatre sont regroupées au sein du complexe d’espèces Rasamsonia argillacea : R. argillacea sensu stricto, R. aegroticola, R. piperina et R. eburnea (Figure 1).
La première description chez l’homme date de 1999 et se rapportait à une colonisation de l’arbre respiratoire chez un patient atteint de mucoviscidose. Depuis, trois des quatre espèces constituant le complexe R. argillacea (R. aegroticola, R. argillacea sensu stricto et R. piperina) sont régulièrement décrites dans ce contexte, R. aegroticola étant l’espèce prédominante. En Europe, la prévalence de ces champignons varie de 0,4% à 2,3% chez le patient mucoviscidosique. Néanmoins, leur fréquence d’isolement est probablement sous-estimée en raison de leur confusion possible avec les champignons des genres Penicillium et Paecilomyces. Plus rarement, ces espèces sont rapportées chez des patients atteints de granulomatose septique familiale au cours de laquelle elles sont majoritairement responsables de pneumonies, mais aussi d’infections disséminées à point de départ pulmonaire.
L’écologie de ces champignons et les modalités d’acquisition chez l’homme sont mal connues. Une contamination par inhalation de spores aéroportées présentes dans l’environnement est toutefois hautement probable, la majorité des isolats cliniques du complexe R. argillacea provenant de prélèvements respiratoires.
Les espèces du complexe R. argillacea sont phénotypiquement très proches. Elles présentent une croissance rapide, les colonies arrivant à maturité au bout de 3 à 5 jours à 37°C (espèces thermophiles). Celles-ci sont de couleur crème et présentent une surface veloutée à finement poudreuse (Figure 2A). Le verso est incolore (Figure 2B). Sur le plan microscopique, les champignons du genre Rasamsonia se caractérisent par des conidiophores fins et hyalins, d’aspect rugueux, qui portent à leur sommet des structures de type pénicilles mono-, bi- ou triverticillés (Figure 2C). Les phialides présentent un col effilé et donnent naissance à des spores unicellulaires disposées en chaînes basipètes. Les conidies sont habituellement cylindriques (plus rarement ellipsoïdales), ce qui constitue un critère majeur pour la différenciation avec d’autres champignons produisant des structures de type pénicilles. Cependant, l’identification précise des espèces du genre Rasamsonia reste difficile et ne peut être uniquement basée sur des critères morphologiques. L’essor de la spectrométrie de masse de type MALDI-TOF pour l’identification des champignons filamenteux aidera probablement à surmonter cette difficulté. En effet, certaines bases de données “maison” ou en ligne permettent désormais de distinguer les espèces au sein du complexe argillacea (ce qui est actuellement impossible avec les bases de données commercialisées qui ne comprennent pas les différentes espèces du genre Rasamsonia). Le séquençage des régions ITS, BenA et/ou Cmd peut également être mis à profit pour cette distinction. En outre, des techniques d’amplification des séquences répétitives de l’ADN permettent une caractérisation infra-spécifique des souches.
L’identification précise des espèces du complexe R. argillacea est essentielle d’un point de vue thérapeutique dans la mesure où leur profil de sensibilité se distingue nettement de ceux des genres Penicillium et Paecilomyces dont elles sont morphologiquement proches. En effet, toutes les espèces du complexe R. argillacea présentent une résistance naturelle au voriconazole et à l’isavuconazole, ainsi qu’une sensibilité variable à l’itraconazole, au posaconazole et à l’amphotéricine B. En revanche, les échinocandines présentent des concentrations minimales inhibitrices basses vis-à-vis des différentes espèces du complexe, notamment la micafungine. Il en est de même pour l’olorofim (F901318), molécule antifongique appartenant à la nouvelle classe des orotomides. Compte tenu de la faible efficacité des dérivés azolés, une surveillance attentive de la colonisation chronique des voies respiratoires chez les sujets atteints de mucoviscidose reste primordiale.
Ces dernières années, les espèces du complexe R. argillacea ont été rapportées de façon croissante en médecine humaine. Il convient de garder à l’esprit qu’une meilleure connaissance de ces pathogènes, aujourd’hui considérés comme émergents, est indispensable pour guider le choix thérapeutique et ainsi améliorer la prise en charge des patients.
Pour plus d’informations, consulter :
- Giraud S, Favennec L, Bougnoux M-E, Bouchara JP. Rasamsonia argillacea species complex: taxonomy, pathogenesis and clinical relevance. Future Microbiol. 2013;8: 967–978.
- Houbraken J, Spierenburg H, Frisvad JC. Rasamsonia, a new genus comprising thermotolerant and thermophilic Talaromyces and Geosmithia species. Antonie Van Leeuwenhoek. 2012;101:403-421.
- Houbraken J, Giraud S, Meijer M, Bertout S, Frisvad JC, Meis JF, Bouchara JP, Samson RA. Taxonomy and antifungal susceptibility of clinically important Rasamsonia species. J Clin Microbiol. 2013; 51:22-30.
- Houbraken J, Kocsubé S, Visagie CM, Yilmaz N, Wang XC, Meijer M, Kraak B, Hubka V, Bensch K, Samson RA, Frisvad JC. Classification of Aspergillus, Penicillium, Talaromyces and related genera (Eurotiales): An overview of families, genera, subgenera, sections, series and species. Stud Mycol. 2020;95:5-169.
- Kirchhoff L, Dittmer S, Buer J, Rath PM, Steinmann J. In vitro activity of olorofim (F901318) against fungi of the genus, Scedosporium and Rasamsonia as well as against Lomentospora prolificans, Exophiala dermatitidis and azole-resistant Aspergillus fumigatus. Int J Antimicrob Agents. 2020;56(3):106105.
- Mouhajir A, Matray O, Giraud S, Mély L, Marguet C, Sermet-Gaudelus I, Le Gal S, Labbé F, Person C, Troussier F, Ballet JJ, Gargala G, Zouhair R, Bougnoux ME, Bouchara JP, Favennec L. Long-term Rasamsonia argillacea complex species colonization revealed by PCR amplification of repetitive DNA sequences in cystic fibrosis patients. J Clin Microbiol. 2016;54:2804-2812.
Anne Totet et Yohann Le Govic
(CHU Amiens-Picardie, Parasitologie et Mycologie & Université de Picardie Jules Verne, UR 4294)
Dekbqv
atorvastatin over the counter buy atorvastatin 20mg generic buy lipitor 80mg for sale
Qluipl
propecia 5mg price order diflucan 100mg pills order diflucan online
Jolvbp
buy baycip pills – cephalexin 250mg oral augmentin where to buy
Njwfpa
buy ciprofloxacin 1000mg generic – trimethoprim cost how to get clavulanate without a prescription
Uphtfg
oral flagyl – cefaclor drug zithromax oral
Kuwtzc
ciprofloxacin 500mg without prescription – buy chloromycetin pills erythromycin 250mg uk
Lmjmaj
order valtrex 1000mg sale – acyclovir 800mg tablet how to buy zovirax
Okcfmw
ivermectin 3 mg otc – buy suprax 100mg online tetracycline 250mg cost
Ckvkbs
flagyl medication – cost flagyl 200mg azithromycin 500mg price
Enrdgy
ampicillin usa penicillin usa amoxicillin pills
Xvydhp
lasix 100mg without prescription – order candesartan 16mg capoten 25 mg generic
Jltkfg
buy generic glycomet – baycip over the counter lincocin 500 mg drug
Wvkdbc
buy zidovudine – epivir over the counter zyloprim without prescription
Mebcaa
clozapine 50mg sale – buy generic famotidine 40mg how to get famotidine without a prescription
Jircmz
buy quetiapine pill – buy desyrel cheap buy generic eskalith over the counter
Ggopjj
buy anafranil 50mg without prescription – remeron 30mg drug buy generic doxepin 25mg
Pfyydw
purchase hydroxyzine – prozac where to buy endep 10mg cheap
Grxhki
cheap clavulanate – generic ethambutol 600mg cipro 500mg tablet
Qtrwsd
purchase amoxil generic – amoxil price order cipro 500mg generic
Ewohtw
buy generic cleocin for sale – cefixime without prescription buy generic chloromycetin over the counter
Lbvrgj
buy azithromycin 250mg pill – ciprofloxacin where to buy order ciprofloxacin 500mg for sale
Qsazyi
buy stromectol – levofloxacin 250mg without prescription cefaclor pills
Dvzrqy
purchase albuterol pills – buy theophylline sale theo-24 Cr 400 mg price
Tjtcio
order clarinex 5mg online – clarinex 5mg drug cost albuterol 4mg
Fyksea
depo-medrol medicine – purchase fluorometholone generic order azelastine generic
Lknfnq
buy glyburide 2.5mg online – dapagliflozin 10 mg sale dapagliflozin 10mg pill
Jiwgpd
cheap prandin 2mg – empagliflozin tablet order empagliflozin 10mg sale
Mccagw
metformin pill – glucophage 1000mg tablet order precose online cheap