Responsable
Sylvain Brisse
Unité Biodiversité et Epidémiologie des Bactéries Pathogènes
Institut Pasteur, Paris
Co-responsables
François GRAVEY
Université Caen Normandie –
CHU de Caen
francois.gravey@unicaen.fr
Laurence Armand-Lefevre
Hôpital Bichat-Claude-Bernard
AP-HP Nord-Université Paris Cité
laurence.armand@aphp.fr
Maxime PICHON
Université de Poitiers – UFR Médecine et Phamacie – CHU de Poitiers
Maxime.PICHON@chu-poitiers.fr
Baptiste Demey
Faculté de Pharmacie
Amiens
Demey.Baptiste@chu-amiens.fr
Philippe Lehours
Université de Bordeaux
CNR des Campylobacters et Hélicobacters
philippe.lehours@u-bordeaux.fr
Description de la section
La section Épidémiologie et Génomique des Populations couvre le vaste champ de la biodiversité des souches au sein des espèces microbiennes, des liens entre les génotypes des souches et les phénotypes (en particulier virulence et pathogenèse), la dynamique des populations et la microévolution des souches. Les applications à l’épidémiologie (typage, épidémiologie moléculaire, réservoirs et voies de transmission) et à la santé publique (surveillance, diagnostics) sont également centraux dans les thèmes d’intérêt de la section. Un accent particulier est mis sur les nouvelles méthodes d’analyses des pathogènes et de leurs populations ou communautés : séquençages de nouvelles génération, génomique, métagénomique, bioinformatique. La section s’intéresse de façon très transversale à tous les types de pathogènes : bactéries, virus, champignons, parasites ; Et aux divers secteurs d’intérêt : microbiologie médicale, vétérinaire, environnementale ou industrielle.
